有收单牌照的第三方支付机构跟银行、银联、商户是怎样清算的？

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目前的收单模式主要分直联和间联
        POS间联是指从POS终端机连接到收单银行（A）的主机系统，当持卡人持银行卡（发卡行B）在POS机上跨行消费的时候，交易信息先发送给收单银行A，再发送给发卡银行B。目前银行和商户签订POS机协议的POS机都是这类间联的。
        POS直联是指从POS终端机直接连接到银联主机，当持卡人持银行卡（发卡行B）消费的时候，交易信息直接发送给发卡行B，收单行A不会得到相应的信息。目前商户和银联签订的POS机一般都是这类。

间联POS模式是由收单银行负责和商户签约，每一方承担相关的义务和责任。间联POS的特点是从商户出来的信息必须通过收单银行的审核环节，转给银联，由银联再转给发卡行。在此种模式下，收单银行可以检测到商户的交易情况。直联方式没有收单银行这一环节，相当于商户的交易直接到银联，再由银联到发卡行。
在间联模式下，银行卡与POS机为同一银行时无须经过银联进行跨行清算。

        中国银联推直联POS机表面上是为了避免银行通过压低扣率的方式抢占市场，实则可以获取可观的收单业务手续费，并巩固银联在人民币银行卡跨行清算方面的专营地位，实现垄断后便可随意定制商户POS机结算手续费的标准和分配比例。
        直联POS是银联自己充当收单行，数据直接到当地银联分公司，经跨行清算后再返回商业银行。直联模式下比较容易产生诸如信用卡套现一类的虚假违规交易，而银联只收取收单行的收益，缺少控制银行卡收单风险的动力，也不承担套现、欺诈等风险。
        间联POS是银行开展消费信贷和交叉销售的基本渠道，也是银行开展资金结算、公司金融服务的纽带，通过银行自己的间联POS可以为商户实现如商户优惠折扣、信用卡积分、分期付款、交叉营销等增值业务。对银行-商户联名卡的优惠更为突出。这是目前银联的直联POS机并不具有这些功能。
        间联POS机是发卡行自己安装并维护商户的账务结算等基本银行服务，因此不向银联缴纳月租费，商户所缴纳的收单费用也是由布放POS机的商业银行协商确定。